2165年、第4次世界大戦が勃発し、核汚染を受けた場所で新たな種が誕生した。人類は「異虫」と呼ばれ、世界構造が再構築され、人類は「異虫」に対抗するために「人類防衛軍」を設立した。100年後、主人公の江辰は行方不明になった父を探して人類防衛軍に入隊するが、人類の知られざる秘密がいくつか発見される…。