活発で大胆で時に無鉄砲な花と、少し臆病で機知を失わない夏無は科学への愛を抱いて科学実験班に志願したが、先生はあいにく噂の中で非常に奇妙な令狐先生だった。ある日師弟3人は偶然にも殺人事件に遭遇し、真犯人を捕まえるために狐先生に科学探偵隊を結成させた。小鬼たちの愛科学が帰らない道はここから始まる……。