名探偵コナン漫画。高校生探偵の工藤新一は、「日本警察の救世主」「平成のホームズ」と呼ばれている。幼なじみの彼女モーリーランドと遊園地に遊びに行ったとき、奇妙な行動をする黒衣の男2人を発見した。新一は彼らを取引現場まで追跡し、別の黒ずくめの男はその不注意に乗じて後ろから棒を倒し、APTX 4869という謎の毒を流し込んで彼を殺そうとしたが、副作用で彼の体は成長期の子供の状態に戻った。黒衣人が生きていることを知っていたら、周囲の親しい友人を巻き込むことになるだろうと考え、新一は毛利蘭の家に居候し、父で探偵を務める毛利小五郎の力を借りて黒衣人を探そうと「江戸川コナン」と名付けた。小五郎は助けてくれないばかりか、そそっかしい探偵だった。だから事件が発生した後、コナンは阿笠博士が発明した腕時計型麻酔銃で小五郎を眠らせ、続いて蝶ネクタイ変声器で彼の声を真似して推理を行い、多くの事件を解決し、同時に多くの仲間を作り、そして黒衣組織の人の行方を探し続け、いつかそれを法にかけて、元の姿に戻したいと思っていた。