世界はやて、神に飲まれ滅びるであろう――。街の端に住み、遺留物の回収を生業とする『サルベージャ』であるレイイは、瓦礫の中、からっとそこに消えた父の面影を追いかけている。崩れ落ちた街の、最奥より現われる巨大な『甲種』。白き翼と黒き光輪を携えて＜それ＞を倒さなければ、人類に未来はない。侵食される世界の中、少年は義足の師と共に神へ至る塔へと挑む！