仁医漫画、南方仁、東都大学脳外科医局長は、生がある34年間、平凡で忙しい単純な医者生活を送っていたが、患者に脳腫瘍を切除した際に「胎児」の形に似た奇妙な腫瘍を発見した後、彼の人生は天地を覆すような変化を遂げた。病院の階段内で口論になって足を滑らせて階段を降りただけだったが、再び目を覚ました時、自分が一八六二年の江戸に戻ってきたことに気づき、彼は未来からの医術で新しい人生を始めた……。