ジョナサンとDIOの死闘から100年、DIOは大西洋から蘇った。また、ジョゼフの外孫?空条承太郎は身代わり能力があることに気づき、DIOの復活で承太郎の母は危篤状態に陥った。命を落とした母を救うため、承太郎は仲間たちと50日間の旅に出て、日本を出発し、エジプトに向かいDIOを倒した。