背骨大爆発から10年が経ち、平行地球E-02は徐々に穏やかになってきた。2050年の夏、大量の帰校留学生を乗せた空の列環がスフィリア大陸に向かって飛んでいたが、偶然にも成層圏に不規則に漂う謎の上古遺跡：補天石を通り過ぎた。タイン大学の学生沈絡はフライトで縁のあった先輩周無翼と知り合い、彼女たちの体内の超自然的な力が目覚めている……