「Flower Warのシーズン3！」環境汚染のため、地球は間もなく滅亡に直面する。この時、地球自身の自浄作用が世界樹（巨大樹）とその周辺に咲く花（守護騎士）を呼び覚ました。環境汚染の主犯である「人間」を攻撃し始め、人間は生き残るために防御ロボットを開発して対抗している……