少年の名前は蓮夜。学問と武術の勉強に励んでいた彼が住む山間部の村に突然武装軍が現れ、攻撃を開始した。この時、Cと名乗る。C。友人たちを救おうとする蓮夜の前に現れた謎の女性は、彼に「力」を与えることができる契約を提案する。この力を「GEASS」という。しかし……！？