刺客信条：蜂起漫画、本漫画のストーリーは刺客信条：刺客と刺客信条：サンクチュアリの後、シャーロットの物語を続け、同時に他の現代刺客及びサンクチュアリマスター兼黒十字のストーリーもある！シャーロット小隊が襲撃されたが、結局は刺客内闘だったのか。現代の刺客デズモンド?マイルズには息子がいるとは？神殿も刺客も背後にある真実を調べているが、双方が秘密を明かすと同時に新たな勢力が台頭している。。。漫画DBで刺客信条：蜂起漫画をご覧ください。