天草Xコミックス。1995年のある朝、日本で阪神大震災が発生した。幼馴染の夏月を救うために傷ついた宮本だったが、それが彼女たちの友情の礎となった。2000年、当時サンフランシス中学校国中部の生徒会乾部たちは高校生だったが、船で卒業旅行をしていたところ、急に空が赤くなり、続いて地震が発生し、仲間たちが江戸時代にやってきた。この時代にはすぐに革命戦争が起こる。今回の革命運動の指導者であるはずの益田四郎（天草四郎）が意外にも命を落としてしまったことを誰が知っているだろうか。そして夏月は地元住民から天神様に憑かれた四郎と誤解され、剣術の優れた夏月は四郎の名で革命戦争に関わり始めた。剣豪?宮本武蔵（記憶を失った宮本政希）を引き込もうと出発した夏月とマイルたちが山中で強盗に遭うと、そこに宮本が現れる…