機動戦士ガンダムSEed Astrayコミックスは、本編の海の中のオシリス衛星が崩壊してから物語が始まる。廃物商のロー?ジュールと彼の回収屋は海の中のオシリスの廃墟に来て「宝」を探していた。偶然にも、廃墟に埋もれていた赤と青の2本のMSと、金色のMS右腕が発見された。ちょうどその時、羅一行は「蛇尾」という傭兵部隊に襲われた。傭兵たちは依頼を受けたと言って、この2機のMSとそれを見た関係者を破棄しようとしたが、双方が硬直していた時、傭兵たちは銃口を廃物商と傭兵の両方に向けた。戦闘中、羅は傭兵の指導者叢雲弾劾に青い機を渡し、自分は赤い機を操り、危険を乗り越えた後、傭兵と廃物商は互いに事業を続けていたが、金色機は行方不明だった。異端の名を背負い、歴史に埋もれていたはずのアストレイがそれぞれの舞台で異なる物語を上演し、正史と交錯し、アストレイに導かれた人々が、歴史のために新たな岐路を切り開く……。