ハルが世界征服を企てた野望が潰された後、地底に潜む新たな勢力が虚勢に乗じて漁夫の利を収める算盤をしていた『海底帝国』は、『戦闘獣』として大軍を振るって地上に侵攻し始めた。まだ平和に浸っている原子光（光子力）研究所は、空前の新たな危機に遭遇し、無敵の鉄金剛もこのような凛とした猛攻には敵わなかった。この万念の存亡が迫る中、隠遁して死んでいなかったコー博士は突然号令をかけて現れた！