西暦2043年12月1日、未知の生命体Babyが人類の世界に侵入し、Babyが人間の体の中に宿って異質になった怪物を虐殺し、地球上の人類を絶滅の危機に瀕させた。歴史は滅亡の日と呼ばれているが、その中で唯一憑依されているが人類の外形を保つことができるヒロインのイレッサは、滅亡の1年後、残された人類を探し始め、体の中に存在するBabyの秘密を解き明かす……。