原作SFロボットアニメ『創聖のアクエリオン』を原作とした漫画版作品で、原作監督は河森正治。12000年前の大戦末に封印された人類の天敵「堕天翅族」は、気候の異常な変化から復活し、再び人類との戦争を繰り広げた。人類はそれに対抗するために、「創聖の書」に記された、伝説の機械天使「アキエリオン」を遺跡から掘り出した。