宇宙世紀0084年。「ディラン紛争」の後、地球連邦軍はエリート化組織「ディタンズ」を設立し、ジオン残党を追跡し続けた。新進将校のイリアドは実験小隊「ラッコ小隊」に配属されたが、ジオン残党の女性将校ヒルダ少尉と出会った後、彼の本来のディタンズに対する信念を揺るがし始めた…