天人組織が崩壊し、世界は連邦を中心とした統合を開始する一方、A-LAWSは武力鎮圧を開始した。そんな時代の中、ある日突然、自分が人間ではないことに気づいた一群の人々が現れた。彼らは革新者（ばかそれは変革者）だった。VEDAを通じて人間の世界に溶け込む人々。なぜ、誰が彼らを「覚醒」させたのか。謎が謎に迫り、新たな『ガンダム00』の物語が始まる。ガンダム漫画シリーズ大神洸一の作品。アニメドラマと同じ背景舞台で、感情のないVEDAは人間を知るために、人間社会に革新者を配置した。彼らは自分たちが人間ではないことに気づかず、見聞きした情報をVEDAに途切れることなく伝えた。彼らの中には、突然「目覚める」人が現れた。彼らには、「6人の仲間」を集めるための使命と能力が与えられている。彼らはなぜこのようにしなければならないのか、このような疑惑を持って普通の人の生活を捨てて、世界の端まで行って、彼らを待つのはどのような運命ですか？…