アイアンマン、トール、キャプテン?アメリカ、ミツバチ、ホークアイ。世界最高峰のスーパーヒーローたちが強力なチームを作っているが、ある程度は米国政府に拘束されている。トニー?スタークは自分が支配する究極の同盟に努めており、政府の弾圧から抜け出すためにマンハッタン通りにある邸宅に人々を集めた。黒豹、ヴァルキリー、快銀、紅の魔女が加わる！究極の同盟も様々な内憂外患に直面し始めた。すべては始まりにすぎない……