主人公の鹿目まどかは親友の美樹さやか、先輩の巴麻美、来佐倉杏子らと、毎晩「悪夢」と戦う。ある日、暁美ほむらは見滝原国中に転校し、まどかたちを加えて5人の魔法少女になり、コオロギとキューピーを加えて「魔法少女聖なる五重奏（PuellaMagicHolyQuintet）」と呼ばれるようになった。