2050年、日本は砂漠に覆われ、4つの独立した小さな国に分裂した。環境はますます悪くなり、生活物資は政府が規制しているが、徐々に不足している。一人の兵士が「花の少女」という病気に感染した少女と出会った。ある日、彼らは襲われ、生死存亡の刻に少女の体に変化が……。