神城麻郁はプログラムを書いてアルバイトをしてお金を稼ぎ、自分で湖畔の小屋を借りて一人暮らしをしている高校1年生。この日学校に行く途中、麻郁は2人の少女に出会った。1人は緑の長い髪を残し、おとなしく内向的な小野寺樺恋、もう1人は、赤いショートヘアで明るく外向的な宮藤深衣奈。この時の麻郁は、この二人の少女が彼の人生に天地を覆すような転換をもたらすことを知らなかった…神