高校2年の春、雨宮蓮は東京の「秀尽学園」に転校した。何かをきっかけに「ペルソナ」の利用者に目覚めたレンは、新たに知り合った仲間たちと「ThePhantom」を結成。メインラインの外に遊離し、印象空間「Mementos」の中で怪盗団が心を歪めた者たちを“改心”させる――心を入れ替える支線任務の物語。壮大な悪漢ロマンの物語は、これで一触即発！