末日後の未来、エネルギー不足に悩む人々は深海で微弱な放射線を持ち、無限のエネルギーを生み出す「魔石」を発見した。「人間の魂が封印されている」というより多くの伝説の魔石を発掘するために、少女とロボットは依然として深海で努力している。