『AldnoahZero外伝：TwinGemini』は、人類が火星で先史文明や超科学的エネルギーを発見したことを「ALDNOAH」と呼んでいる。ある日、火星から「騎士」が降ってきた。これらの鉄鋼巨人は地球上のすべての人類を殲滅する明確な来意を持っている。火星に移住した人類と地球上の人類、両陣営間の戦争が始まった。戦争に巻き込まれた少年少女たちの行方は。